Didattica

Sicurezza in laboratorio: rischi chimici e biologici

Docente: Daniele Del Buono

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Sicurezza in laboratorio: rischi chimici e biologici

Descrizione del corso
Il corso mira a illustrare alcuni aspetti normativi relativi alle attuali leggi sulla sicurezza sul lavoro, con particolare riferimento agli obblighi in materia di salute e sicurezza. Inoltre, il corso mira a fornire concetti che consentano ai dottorandi di assumere un atteggiamento responsabile e sicuro in laboratorio, che permetta loro di ridurre il rischio derivante dalla manipolazione di sostanze pericolose e/o tossiche fino allo stoccaggio e allo smaltimento.

Verifica finale: SI (orale)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: C: Didattica frontale e trasversale a carattere multi-, inter-, trans-disciplinare

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Database bibliografici e principi di bibliometria

Docente: Gianandrea Salerno

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Database bibliografici e principi di bibliometria

Descrizione del corso
Il corso fornisce una breve descrizione delle banche dati bibliografiche più comuni, con particolare attenzione a Scopus e WOS (Web of Science), e indica i principali metodi e obiettivi della ricerca bibliografica. Vengono fornite informazioni sulla valutazione della ricerca, sulle origini, le caratteristiche e gli scopi della bibliometria, sul ruolo e l'importanza delle citazioni e sui possibili problemi che ne derivano. Vengono fornite informazioni relative ai vari indicatori bibliometrici, indicandone il significato e il metodo di calcolo. Vengono illustrate le caratteristiche delle fonti di dati bibliometrici (Web of Science,  Scopus, Google Scholar), evidenziandone i possibili limiti e le criticità. Vengono forniti esempi di applicazione degli indicatori bibliometrici per la valutazione di individui o strutture (Unità di Ricerca, Dipartimenti, Università) nel quadro delle applicazioni italiane (ASN, VQR).

Verifica finale: SI (orale)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: C: Didattica frontale e trasversale a carattere multi-, inter-, trans-disciplinare

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Metodi sperimentali in biologia

Docente: Andrea Onofri

CFU: 4

Ore: 24

Denominazione dell’insegnamento: Metodi sperimentali in biologia

Descrizione del corso
Esperimenti scientificamente validi sono la chiave fondamentale per il progresso scientifico. Lo scopo di questo corso è quello di introdurre gli studenti all'organizzazione di esperimenti scientifici e al processo di analisi dei dati, che dovrebbe sempre produrre dati e conclusioni affidabili e imparziali, da presentare utilizzando il formato appropriato e con informazioni complete e corrette.

Verifica finale: SI (Realizzazione di un elaborato)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: C: Didattica frontale e trasversale a carattere multi-, inter-, trans-disciplinare

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Come preparare figure e tabelle per un articolo scientifico

Docente: Roberto Romani

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Come preparare figure e tabelle per un articolo scientifico

Descrizione del corso
Il corso mira a fornire ai dottorandi gli strumenti di base per gestire software per la preparazione di elementi grafici per un articolo scientifico, quali tabelle e figure. Utilizzo di alcuni software specifici (sia open source che commerciali) per la preparazione di tabelle, grafici e illustrazioni; Capacità di organizzare i contenuti in elementi grafici adatti alla pubblicazione su riviste scientifiche; Analisi e interpretazione delle linee guida delle riviste scientifiche per tabelle, grafici e illustrazioni.

Verifica finale: SI (Realizzazione pratica di un prodotto grafico)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Cambiamenti climatici: cause ed effetti

Docente: Francesca Todisco

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: Cambiamenti climatici: cause ed effetti

Descrizione del corso
Il corso mira a fornire gli strumenti per interpretare correttamente le informazioni, le previsioni e le tendenze pubblicate nel campo dei cambiamenti climatici e a fornire informazioni generali sul modello globale utilizzato per prevedere i cambiamenti climatici su scala continentale.

Verifica finale: SI (Orale)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Applicazioni della microscopia nelle scienze agrarie e ambientali

Docente: Lara Reale

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Applicazioni della microscopia nelle scienze agrarie e ambientali

Descrizione del corso
Questo corso mira a fornire i principi teorici e mostrare esempi pratici delle principali tecniche di microscopia utilizzate nella ricerca agricola e ambientale. Verranno trattati gli aspetti teorici relativi alle proprietà della luce, allo stereomicroscopio, alla microscopia ottica, alla microscopia a epifluorescenza, alla microscopia elettronica a scansione e a trasmissione. Il corso presenterà inoltre i protocolli attualmente in uso e fornirà esempi pratici di ricerche in cui la microscopia svolge un ruolo fondamentale. L'obiettivo finale è quello di mostrare le potenzialità delle diverse tecniche, in modo che il dottorando possa decidere se possono essere utili nel suo progetto di ricerca.

Verifica finale: SI (Scritta)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Come scrivere un articolo scientifico

Docente: Eric Conti

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: Come scrivere un articolo scientifico

Descrizione del corso
Comprendere l'importanza della pubblicazione scientifica, acquisire conoscenze e competenze sulla scrittura scientifica e sul processo di pubblicazione su riviste sottoposte a revisione paritaria. Risultati di apprendimento previsti. - Comprendere i meccanismi della pubblicazione scientifica sottoposta a revisione paritaria - Migliorare la capacità di progettare l'impaginazione e iniziare a scrivere un articolo di ricerca o di revisione - Migliorare lo stile scientifico e la chiarezza nella scrittura.

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Progettazione di costrutti genetici per l'ingegneria genetica vegetale e l'editing genomico

Docente: Daniele Rosellini

CFU: 3

Ore: 18

Denominazione dell’insegnamento: Progettazione di costrutti genetici per l'ingegneria genetica vegetale e l'editing genomico

Descrizione del corso
Questo corso si terrà in un laboratorio informatico. Gli studenti acquisiranno innanzitutto familiarità con la piattaforma Benchling ad accesso libero per l’analisi delle sequenze. Impareranno a conoscere il sistema di clonazione Golden Gate e come utilizzare la piattaforma Golden Braid per l’assemblaggio di costrutti genetici. Successivamente realizzeranno i propri progetti di progettazione e assemblaggio di costrutti finalizzati alla sovraespressione di un gene e al knockout dello stesso gene utilizzando la tecnologia CRISPR-Cas9. Infine, utilizzeranno strumenti software online per valutare i risultati di un esperimento di inattivazione genica utilizzando i dati di sequenza provenienti da un progetto reale.

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Conservazione della biodiversità vegetale, animale e microbica

Docenti: Daniela Gigante, Emiliano Lasagna, Lorenzo Raggi, Benedetta Turchetti

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: Conservazione della biodiversità vegetale, animale e microbica

Descrizione del corso
Questo corso tratterà il tema della conservazione della biodiversità vegetale, animale e microbica, sottolineandone il ruolo fondamentale nel funzionamento degli ecosistemi e nello sviluppo sostenibile. Particolare enfasi sarà posta sul ruolo strategico delle collezioni come strumenti essenziali per la ricerca, la conservazione e l’educazione. Il corso esaminerà inoltre i principi e gli obiettivi della Convenzione sulla diversità biologica (CBD), del Trattato internazionale sulle risorse fitogenetiche per l’alimentazione e l’agricoltura (ITPGRFA) e del Protocollo di Nagoya, con particolare attenzione all’accesso alle risorse genetiche e alla condivisione equa e giusta dei benefici derivanti dal loro utilizzo.

Verifica finale: SI (orale)

Anno di corso consigliato: 1

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Come presentare i risultati della ricerca scientifica

Docente: Lorenzo Covarelli

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Come presentare i risultati della ricerca scientifica

Descrizione del corso
Durante il corso verranno illustrate la diffusione e la presentazione dei risultati scientifici. In particolare, verranno spiegati sia l'abstract di una conferenza che la presentazione dei risultati, sotto forma di poster o comunicazione orale. Alla fine del corso, agli studenti verrà chiesto di presentare parte dei propri risultati sotto forma di abstract o poster. Risultati di apprendimento previsti: - Preparazione e presentazione di abstract; - Presentazione dei risultati (poster e orale); - Miglioramento delle capacità di scrittura e presentazione.

Verifica finale: SI (presentazione di un poster o comunicazione orale)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

 Metriche per l'economia circolare

Docente: Lucia Rocchi

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: Metriche per l'economia circolare

Descrizione del corso
Il corso mira a introdurre i principi generali di valutazione e misurazione nel contesto dell'economia circolare, attingendo al quadro stabilito dalla Dichiarazione di Bellagio. Verranno presentati alcuni dei principali indicatori attualmente in uso, con particolare attenzione alla loro applicazione alle filiere agroalimentari. Il corso comprende anche attività pratiche che prevedono l'analisi e l'applicazione di tali indicatori a casi di studio.

Verifica finale: SI (Realizzazione di un elaborato / presentazione)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

 Metodi sperimentali avanzati in biologia

Docente: Andrea Onofri

CFU: 4

Ore: 24

Denominazione dell’insegnamento:  Metodi sperimentali avanzati in biologia

Descrizione del corso
Questo corso fa seguito al corso base "Metodi sperimentali in biologia" (1° anno) e ha lo scopo di approfondire le conoscenze degli studenti sulla progettazione di esperimenti e l'analisi dei dati con R. Risultati di apprendimento previsti: - Introdurre gli studenti all'uso avanzato del software R - Introdurre gli studenti alle procedure avanzate di gestione dei dati con R - Introdurre gli studenti alla statistica multivariata e alle sue applicazioni con R

Verifica finale: SI (realizzazione di un elaborato)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

GIS e telerilevamento per applicazioni agroambientali

Docente: Marco Vizzari

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: GIS e telerilevamento per applicazioni agroambientali

Descrizione del corso
Il corso mira a fornire conoscenze sui sistemi informativi geografici (GIS) e sulle tecniche di telerilevamento applicate specificamente agli agroecosistemi e alla ricerca ambientale. Gli studenti svilupperanno competenze tecniche e analitiche per acquisire, elaborare e interpretare dati geospaziali per il monitoraggio dei paesaggi agricoli, la valutazione delle dinamiche degli ecosistemi e il sostegno alla gestione sostenibile delle risorse nel contesto dei cambiamenti climatici e delle sfide alla sicurezza alimentare.

Verifica finale: SI (realizzazione di un elaborato / presentazione)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

 Principi del Life Cycle Assessment in agricoltura

Docente: Pietro Goglio

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Principi del Life Cycle Assessment in agricoltura

Descrizione del corso
Identificare i principi del Life Cycle Assessment. Descrivere i principi chiave della valutazione del ciclo di vita applicati ai sistemi agricoli. Fornire informazioni approfondite sul processo decisionale ambientale nella vita reale. In particolare: Parte 1: Introduzione al concetto di ciclo di vita; Parte 2: Storia, standard e normative della LCA; Parte 3: Unità funzionali; Parte 4: Confini del sistema; Parte 5: Espansione e allocazione del sistema; Parte 6: Valutazione dell'impatto del ciclo di vita.

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Fermentazione degli alimenti

Docente: Giovanni De Francesco

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Fermentazione degli alimenti

Descrizione del corso
I cibi fermentati sono un settore emergente dell'industria alimentare che sta suscitando grande interesse anche tra i consumatori. Il corso prevede uno studio approfondito della fermentazione alimentare. La prima parte sarà dedicata alle bevande fermentate, con particolare attenzione a birra, sidro, idromele, kombucha, ecc.. La seconda parte si concentrerà sugli alimenti fermentati come miso, tofu, crauti, olive, pesce fermentato. La parte finale del corso si concentrerà sulle possibili strategie per ridurre il sale, il cui elevato contenuto in molti alimenti fermentati sembra limitarne il consumo.

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Come recensire un articolo scientifico

Docente: Eric Conti

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento:  Come recensire un articolo scientifico

Descrizione del corso
Comprendere il processo di revisione tra pari e pubblicazione in ambito scientifico; acquisire conoscenze e alcune competenze sulla revisione tra pari, su come affrontare un articolo e su come procedere con le revisioni per le riviste scientifiche. Risultati di apprendimento previsti: - Comprendere l'importanza della revisione tra pari per le riviste scientifiche e quando una richiesta di revisione può essere accettata - Comprendere l'etica e le regole della revisione tra pari - Acquisire alcune competenze per affrontare la revisione di un articolo scientifico - Imparare a interagire correttamente con editori e autori

Verifica finale: SI (orale)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Come scrivere una tesi di dottorato

Docente: Lorenzo Covarelli

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Come scrivere una tesi di dottorato

Descrizione del corso
Durante il corso verranno fornite informazioni su come scrivere una tesi di dottorato di successo. In particolare, verranno fornite indicazioni su come eseguire una buona revisione della letteratura, seguite dall'illustrazione della suddivisione dei capitoli e da indicazioni su font, copertina, titolo, indice, sommario, grafici, figure e tabelle. Al termine del corso gli studenti dovranno preparare una presentazione in Power Point sulla struttura della propria tesi di dottorato. Risultati di apprendimento previsti: - Imparare a svolgere una revisione della letteratura; - Scrivere una tesi di dottorato di successo; - Pubblicazione della tesi su riviste scientifiche peer-reviewed

Verifica finale: SI (presentazione della struttura della propria tesi di dottorato)

Anno di corso consigliato: 3

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Introduzione alla proprietà intellettuale

Docente: Bianca Maria Torquati

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Introduzione alla proprietà intellettuale

Descrizione del corso
Il corso mira a fornire una panoramica sistematica della proprietà intellettuale delle invenzioni e del suo ruolo nella bioeconomia moderna. Il corso fornisce agli studenti una serie di concetti e approcci economici sull'innovazione biotecnologica. Verranno discussi i vantaggi economici del sistema dei brevetti e il suo ruolo nella promozione dell'innovazione e nell'incoraggiare gli investimenti. Risultati di apprendimento previsti. - Rendere un'innovazione di prodotto o di processo accessibile alla società e commerciabile - Ottenere la proprietà intellettuale (IP).

Incluso seminario dell'Avv. Alessandro Bura 

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 3

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Effetto del sistema di allevamento sui pilastri fondamentali della produzione animale

Docente: Cesare Castellini

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: Effetto del sistema di allevamento sui pilastri fondamentali della produzione animale

Descrizione del corso
Serie di lezioni sulla sostenibilità della produzione animale. I corsi forniranno un'analisi approfondita sull'effetto del sistema zootecnico (intensivo, estensivo e biologico). In particolare, gli argomenti trattati saranno: caratteristiche qualitative e nutrizionali della carne e delle uova; impatto ambientale e sostenibilità; resilienza dei sistemi (biodiversità, benessere degli animali, risposta immunitaria, resistenza allo stress ambientale e adattabilità); un approccio al benessere.

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 3

Tipologia: A - Didattica frontale erogata dal Corso di Dottorato

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

Partenariato per la ricerca e l’innovazione nell’area mediterranea (progetto PRIMA)

Docente: Michela Farneselli

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Partenariato per la ricerca e l’innovazione nell’area mediterranea (progetto PRIMA)

Descrizione del corso
Questo corso introduce il quadro di riferimento della Fondazione PRIMA, concentrandosi sulla gestione sostenibile delle risorse idriche, sui sistemi agroalimentari e sullo sviluppo rurale nel Mediterraneo. Gli studenti approfondiscono la progettazione di progetti transnazionali, i meccanismi di finanziamento e il coinvolgimento delle parti interessate, sviluppando competenze che consentano loro di contribuire alle iniziative di ricerca euromediterranee in linea con gli obiettivi di sostenibilità dell’UE.

Verifica finale: SI (presentazione)

Anno di corso consigliato: 3

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

PhD thesis layout design

Docente: Milos Sevarika/Roberto Romani

CFU: 2

Ore: 12

Denominazione dell’insegnamento: PhD thesis layout design

Descrizione del corso
Questo corso è pensato per i dottorandi dell'ultimo anno che desiderano realizzare impaginazioni professionali e conformi ai requisiti universitari per la propria tesi di dottorato. Il corso è rivolto ai principianti e introdurrà gli studenti ad Adobe InDesign; non è quindi richiesta alcuna esperienza precedente. Fornirà agli studenti le competenze essenziali per produrre tesi curate e pronte per la pubblicazione. Il programma, della durata di 12 ore, offre un percorso di apprendimento strutturato che copre le tecniche di InDesign dal livello base a quello intermedio, con particolare attenzione alla formattazione della tesi. Gli argomenti trattati includono l'impostazione del documento, gli stili di carattere e di paragrafo, la gestione di grafici e tabelle, i profili colore e la preparazione alla stampa con controlli preflight. Al termine del corso, gli studenti saranno in grado di organizzare e progettare con sicurezza la propria tesi in modo da soddisfare gli standard accademici e professionali.

Verifica finale: SI (realizzazione pratica di un capitolo della tesi)

Anno di corso consigliato: 3

Tipologia: C: Didattica frontale e trasversale a carattere multi-, inter-, trans-disciplinare

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche

 Programma LIFE: lo strumento di finanziamento dell’UE per l’ambiente

Docente: Corrado Marcenò

CFU: 1

Ore: 6

Denominazione dell’insegnamento: Programma LIFE: lo strumento di finanziamento dell’UE per l’ambiente

Descrizione del corso 

Il programma LIFE è lo strumento di finanziamento dell’Unione europea per le azioni a favore dell’ambiente e del clima. LIFE è stato avviato nel 1992 e nel 2022 festeggia 20 anni di attività. L’obiettivo generale di LIFE è contribuire all’attuazione, all’aggiornamento e allo sviluppo delle politiche e della legislazione dell’UE in materia di ambiente e clima attraverso il cofinanziamento di progetti. I suoi settori principali comprendono la natura e la biodiversità, l’economia circolare e la qualità della vita, la mitigazione e l’adattamento ai cambiamenti climatici, nonché la transizione verso l’energia pulita. Il corso presenterà il programma LIFE e le sue varie fasi dal 1992 ad oggi. Illustrerà le tappe principali che portano dalla presentazione della domanda all’ottenimento del finanziamento. I dottorandi acquisiranno una comprensione della struttura e della gestione dei progetti LIFE attraverso l’analisi di alcuni progetti completati o in corso. Inoltre, il corso presenterà i risultati di alcuni dei principali progetti europei e italiani, con particolare attenzione a quelli finanziati nell’ambito della Rete Natura 2000 sul territorio umbro. L’obiettivo del corso è quindi quello di formare i dottorandi sul programma LIFE, sulle sue modalità di accesso ai finanziamenti e sulla struttura e gestione dei progetti finanziati.

Verifica finale: SI (orale)

Anno di corso consigliato: 2

Tipologia: B - Didattica frontale erogata da altri Corsi di Dottorato suggerita dal Collegio dei docenti

Curriculum di riferimento: Scienze biologiche e biodiversità degli ecosistemi, Scienze e tecnologie alimentari e zootecniche